مسجد صفوی، یکی از مسجدهای قدیمی کاظمین است که در مجاورت صحن دو امام مطهر واقع شده است. مسجدی که شاه اسماعیل صفوی آن را در 926 ق بنیاد نهاده است.
این مسجد پس از چهار قرن، هم چنان محکم و استوار است و نشان از زیبایی و استحکام معماری عصر صفوی دارد.
مسجد صفوی وسط ضلع شمالی و متصل به رواق است و با سه درب به رواق شمالی وصل می شود. منبر داخل آن نیز از شاهکارهای عصر صفوی است.
این مسجد در زمان صدام به عنوان انبار مورد استفاده قرار گرفت که با مسدود شدن هواکش های نمگیر کف آن رو به تخریب بود.
با ورود ستاد بازسازی عتبات عالیات در سال 1390 مسجد به شکل اول خود مرمت و نوسازی شد که این پروژه نزدیک به دوسال به طول انجامید.
دیوارهای مسجد از آجرچینی های زیبا و بی نظیر بهره برده است و بر روی سقف آن نیز از هنر آینه کاری استفاده شده است. برای تزئین پایین دیوارها و ستون های مسجد از سنگ مرمر پرتقالی استفاده شده است.
در مرمت این مسجد، 2000 مترمربع سنگ کف و 2000 مترمربع سنگ دیواره،5500 مترمربع مرمت آجر، 1400 مترمربع رسمی بندی و آینه کاری، 240 تنسبک سازی سقف، مرمت سقف، عایق کاری و ایزولاسیون و 1100 متر کانال کشی انجام شده است.
تخریب، مقاوم سازی سنگ بدنه قدیم به همراه تعبیه کانال تهویه هوا و مقاوم سازی کف، سنگ فرش ایوانها که در دو بخش 260 مترمربع بدنه و 350 مترمربع کف ورودی ایوانها به مسجد بر اساس طراحی دکتر زرگر از اساتید دانشگاه شهید بهشتی بوده است.